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BTX機箱內部則和ATX有著較大的區別，BTX機箱讓人關注的設計重點就在于對散熱方面的改進，CPU、圖形卡和內存的位置相比ATX架構都完全不同，CPU的位置完全被移到了機箱的前板，而不是原先的后部位置，這是為了更有效的利用散熱設備，提升對機箱內各個設備的散熱效能。為此，BTX架構的設備將會以線性進行配置，并在設計上以降低散熱氣流的阻抗因素為主;通過從機箱前部向后吸入冷卻氣流，并順沿內部線性配置的設備，在機箱背部流出。這樣設計不僅更利于提高內部的散熱效能，而且也可以因此而降低散熱設備的風扇轉速，保證機箱內部的低噪音環境。